A Paróquia Universitária do Sagrado Coração de Jesus foi criada por D. Aloysio José Leal Penna, bispo diocesano de Bauru, aos 06 de junho de 1991 e, foi constituída de parte da Paróquia de Santa Rita de Cássia de Bauru. Esta paróquia foi criada ao mesmo tempo como uma paróquia territorial e paróquia pessoal, assim criada por seu carácter de atendimento à população universitária, em todas as suas funções.

Inicialmente, as missas ocorriam no campus da antiga Universidade do Sagrado Coração (USC), hoje UNISAGRADO. Em 2001, a paróquia conquistou sua sede própria no Jardim Panorama, com um projeto arquitetônico futurista desenvolvido pelo arquiteto bauruense Jurandyr Bueno Filho, célebre pelos seus projetos como o Parque Vitória Regia e o campus do UNISAGRADO. O edifício de mais de 3 mil metros quadrados se destaca pelo seu formato e pelo grande painel do Sagrado Coração de Jesus no altar, representando um símbolo de fé e acolhimento para a comunidade acadêmica. Embora ainda esteja em fase de finalização, o templo já é considerado um dos maiores em área construída na cidade, oferecendo um ambiente inspirador e espiritual para todos.

Aos 25 de agosto de 2000, D. Aloysio José Leal Penna, já como Arcebispo Metropolitano de Botucatu e Administrador Apostólico de Bauru, por decreto, institui o Santuário Diocesano do Sagrado Coração de Jesus, destinando-o a celebrações religiosas e demais atividades que estimulem a Pastoral Universitária, o diálogo com o mundo da cultura e aos fiéis em geral.

A gestão do Padre Leonildo Minutti Júnior na Paróquia do Sagrado Coração de Jesus de Bauru foi marcada por uma importante reestruturação pastoral após a saída do Padre Enedir Moreira. Padre Junior foi fundamental para sustentar a comunidade durante a pandemia de Covid-19, demonstrando dedicação e liderança. Durante seu mandato, promoveu a reforma da cozinha, construiu a atual secretaria, salas do padre, do diácono, sala de reunião e copa, fortalecendo a infraestrutura da paróquia. Além disso, criou a Pastoral da Comunicação, fortaleceu a equipe de eventos e o apostolado do oratório, impulsionando ações de evangelização e integração da comunidade. Sua gestão deixou um legado de renovação e fortalecimento da fé na paróquia.

No dia 14 de maio de 2021, o Padre Rodrigo Sena tomou posse como pároco da Paróquia. Desde então, ele tem dado continuidade aos trabalhos iniciados pelo Padre Enedir Moreira e pelo Padre Leonildo Minutti Júnior, fortalecendo a fé e a comunidade universitária. Com dedicação e entusiasmo, Padre Rodrigo tem promovido ações pastorais, celebrações e projetos que visam a integração e o crescimento espiritual de todos os fiéis. Sua presença tem sido fundamental para manter viva a missão de evangelizar e acolher a todos na paróquia.

A Paróquia Universitária continua a ser um ponto de encontro e apoio para universitários e a comunidade, integrando fé, cultura e formação em sua missão pastoral.